电影《加美拉2：雷基欧之挑战》由金子修介导演，永岛敏行、水野美纪、石桥保、吹越满和藤谷文子主演。故事背景设定在卡美拉与卡欧斯的决战之后的冬天，北海道突然出现了一场罕见的流星雨。其中一颗陨石坠落在距离支笏湖南西方约一公里的地方。接到消息后，陆上自卫队第11师团立即派遣了化学防护小队前往调查。

渡良瀬佑介二佐和花谷陆尉获得了这次任务，他们深入调查后发现，陨石是真实存在的。五天后，事件的源头开始显现。札幌市地下铁在隧道内遭到一种未知生物的攻击。与此同时，北海道札幌市的薄野出现了一片巨大的植物区域。这些巨大的植物中突然爆发出一群体长达3米、形似昆虫的甲壳类生物。这些被称为“Legion”的怪虫与植物一同从流星陨落到地球上，它们之间存在着一种共生关系。Legion依靠啃食植物的硅酮，同时分泌氧气来促进植物的生长。由于这种环境中氧气浓度极高，地球上的生物无法在其中生存。

为了解决这一问题，自卫队决定采用爆破手段来处理这些巨大的植物。就在此时，海上自卫队探测到卡美拉正朝着札幌飞来的消息传来......