《星际之门：亚特兰蒂斯》是一部科幻剧，故事以地球和星际之间的冒险为主线。曾经居住在地球上的先知种族Ancient移居到南极，并在那里建立了一座前哨站，拥有他们的科技武器，用以保护地球。随着成立南极联盟和国际合作的加强，人们开始研究前哨站的科技，并发现了Ancient离开地球去往的目的地——飞马座星系。

为了探索未知世界和寻找已经失传的历史，各个国家组成了亚特兰蒂斯探险队，通过星际之门前往亚特兰蒂斯城，这是数百万年前从地球飞离的城市。然而，他们的到来却唤醒了统治飞马座星系的Wraith，一群称为Wraith的怪物。这些Wraith拥有先进的技术和强大的身体，他们残暴而无情，以人类为食，吸取人类的生命力。探险队还发现一个惊人的事实：Wraith原本是Ancient试验的产物。

为了对抗Wraith的强大势力，亚特兰蒂斯小队必须勇敢地探索飞马座星系的各个星球，并与飞马座星系的原住民建立联系，试图找到抵御Wraith的方法。在这个过程中，他们经历了一次次险象环生的旅程。

《星际之门：亚特兰蒂斯》是作为《星际之门》的一个衍生剧集开始的。原本计划要拍摄第八季的《星际之门》，但最后决定将这部剧集改为两集的季末终结篇，同时把故事背景转移到飞马座星系的亚特兰蒂斯。这样一来，观众可以在同一个虚构宇宙中同时观看这两个节目，并且两个节目之间开始互相连接。

《星际之门：亚特兰蒂斯》由原班人马在同一个摄影棚里制作。该剧集于2004年7月16日在美国Sci-Fi频道首播，乔·弗拉尼甘和托蕊·海金森担任主演，瑞秋·鲁特雷尔、Rainbow Sun Francks、大卫·休利特和保罗·麦吉利恩则扮演配角。后来，Jason Momoa接替Francks加入了剧集的常规演员阵容。该剧集于第五季完结。